1、在线灭菌:采用在线蒸汽灭菌时,一定要考虑滤芯材质是否能耐受灭菌必须的温度和压差,灭菌前要排净管路和过滤器中的冷凝水;灭菌中要让整个过滤系统每个点都要达到灭菌必须的温度,同时注意滤芯前后压差不能超过额定值;灭菌后过滤系统内要通入氮气或其他洁净的气体来降低系统温度,同时使系统内保持一定的正向压力,使系统内处于无菌状态;
2、离线灭菌:离线灭菌一般常用真空灭菌的方法。灭菌时要注意过滤和滤芯的放置位置,必须保证过滤器进口、出口、排污口、压力表口等各个管口都能被蒸汽透过,保证过滤器腔体内面能充分接触蒸汽;
3、辐射灭菌:对于不方便使用在线灭菌和离线灭菌的过滤器和其他附件,可采用辐射灭菌的方法。有些附件辐射灭菌的次数不能太多,否则有可能增加可提取物水平。